在长期的办学实践中，东南大学形成了“严谨求学、团结奋进”的优良校风和“严谨笃学、敏思创新、质朴诚信”的优良学风以及“重基础、重实践、重素质”的育人传统和“文化育人”的理念，坚持“教书育人、管理育人、服务育人”三位一体。学校为学生提供丰富优质的课程资源，实施通识教育基础上的宽口径专业培养模式和以学生为中心、以教师为主导的“理论教学、实践教学、自主研学、网络助学”四位一体的教学模式，强调学生获取运用知识与创新能力的培养；学校广搭学生自主研学平台，大力推进大学生科研计划，鼓励学生参加各类学科竞赛、科技创作等活动，为学生发展专业特长提供良好条件；实行灵活的学分制和弹性学制、逐步扩大学生选择学习进程、选择课程、选择教师的空间，学生可在取得规定学分后提前毕业，也可根据自身情况分阶段完成学业或延长学习年限。
          为有利于学生个性发展，入学一年后，符合学校“转系、转专业实施细则”的学生可按照自己的志向提出转系、转专业申请，经学校考核合格后，可转系、转专业学习。被我校电类、机械动力类、土木建筑类等专业录取的高考优秀生可在收到“东南大学吴健雄学院申请表”后提出申请，经考核择优转入吴健雄学院学习。